研究業績 (2010, 2011)

[原著] [総説等] [学会発表] (written in Japanese and English)

原著

  1. Matsuyama, S., Aydan, A., Ode, H., Hata, M., Sugiura, W., Hoshino, T. : Structural and Energetic Analysis on the Complexes of Clinically-isolated Subtype C HIV-1 Proteases and Approved Inhibitors by Molecular Dynamics Simulation. J. Phys. Chem. B 114, 521-530 (2010)
  2. Mao, Y., Shang, Z., Imai, Y., Hoshino, T., Tero, R., Tanaka, M., Yamamoto, N., Yanagisawa, K., Urisu, T. : Surface-induced phase separation of a sphingomyelin/cholesterol/ganglioside GM1-planar bilayer on mica surfaces and microdomain molecular conformation that accelerates Abeta oligomerization. Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes 1798, 1090-1099 (2010)
  3. Sano, E., Li, W., Yuki, H., Liu, X., Furihata, T., Kobayashi, K, Chiba, K., Neya, S., Hoshino, T. : Mechanism of the decrease in catalytic activity of human cytochrome P450 2C9 polymorphic variants, investigated by computational analysis. J. Computat. Chem. 31, 2746-2758 (2010)
  4. Neya, S., Suzuki, M., Hoshino, T., Ode, H., Imai, K., Komatsu, T., Ikezaki, A., Nakamura, M., Furutani, Y., Kandori, H. : Molecular Insight of Intrinsic Heme Distortion to the Ligand Binding in Hemoprotein. Biochemistry 49, 5642-5650 (2010)
  5. Suzuki, S., Urano, E., Hashimoto, C., Tsutsumi, H., Nakahara, T., Tanaka, T., Nakanishi, Y., Maddali, K., Han, Y., Hamatake, M., Miyauchi, K., Pommier, Y., Beutler, J. A., Sugiura, W., Fuji, H., Hoshino, T., Itotani, K., Nomura, W., Narumi, T., Yamamoto, N., Komano, J. A., Tamamura, H. : Peptide HIV-1 Integrase Inhibitors from HIV-1 Gene Products. J. Med. Chem. 53, 5356-5360 (2010)
  6. Shang, Z., Mao, Y., Tero, R., Liu, X., Hoshino, T., Tanaka, M., Urisu, T. : Clustering effects of GM1 and formation mechanisms of interdigitated liquid disordered domains in GM1/SM/CHOL-supported planar bilayers on mica surfaces. Chem. Phys. Lett. 497, 108-114 (2010)
  7. Imai, Y., Liu, X., Yamagishi, J., Mori, K. Neya, S. Hoshino, T. : Computational Analysis of Water Residence on Ceramide and Sphingomyelin Bilayer Membranes. J. Mol. Graphics Model. 29, 461-469 (2010)
  8. Li, W., Shen, J., Tang, Y., Hoshino, T. : Exploring coumarin egress channels in human cytochrome P450 2A6 by random acceleration and steered molecular dynamics simulations. Proteins 79, 271-281 (2011)
  9. Yanagita H., Urano E., Matsumoto K., Ichikawa R., Takaesu Y., Ogata M., Murakami T., Wu H., Chiba J., Komano J., Hoshino T. : Structural and Biochemical Study on the Inhibitory Activity of Derivatives of 5-nitro-furan-2-carboxylic acid for RNase H Function of HIV-1 Reverse Transcriptase. Bioorg. Med. Chem. 19, 816-825 (2011)
  10. Neya, S., Kawaguchi, A. T. : Inherently distorted heme as a novel tool for myoglobin-based oxygen carrier. Artificial Organs , in press (2011)
  11. Mahmood M.I., Matsuo Y., Neya, S., Hoshino T. : Computational analysis on the binding of epitope peptide to human leukocyte antigen class I molecule A*2402 subtype. Chem. Pharm. Bull. (2011) in press

総説等

学会発表

  1. 山岸純也、沖本憲明、星野忠次：Prediction of binding mechanism of beta-amyloid 42 peptides with GM1/SM/CHL membrane. 計算科学研究センターワークショップ, 岡崎（2010.1.13)
  2. 鈴木優章, 根矢三郎：ポルフィリンをベースにした腫瘍選択的SPECTプローブの開発. “For SPECT”標識プローブの新規開発による医薬イノベーションの創出 ―分子イメージングを利用したがんの診断・治療の促進―”2008〜2009年度研究成果発表会，千葉（2010.2.22)
  3. 鈴木優章, 星野忠次, 根矢三郎：βアルキル置換ヘキサフィリン（1.1.1.1.1.1）の合成と同定． 日本化学会第90春季年会, 2PA-101，大阪（2010.3.27)
  4. 根矢三郎, 鈴木優章, 星野忠次：ヘムの非平面化によるヘムタンパク質の機能制御法の開発．日本薬学会第130年会, 29P-am359, 岡山（2010.3.29)
  5. 柳田浩志, 松元輝礁, 浦野恵美子, 駒野淳, 星野忠次：新規HIV-1逆転写酵素RNase H活性阻害薬の設計と合成． 日本薬学会第130年会, 29P-am410, 岡山（2010.3.29)
  6. 藍檀愛, 萩原洋子, 鈴木優章, 根矢三郎, 星野忠次：V82A,I84V変異を標的としたHIV-1プロテアーゼ阻害薬の設計． 日本薬学会第130年会, 29P-am411, 岡山（2010.3.29)
  7. 原田壮一郎, 鈴木優章, 根矢三郎, 星野忠次：HIV-1逆転写酵素の結晶構造の分解能を向上させる変異に関する分子動力学的研究． 日本薬学会第130年会, 29P-am412, 岡山（2010.3.29)
  8. 山岸純也, 沖本憲明, 末永敦, 岡田眞理子, 泰地真弘人, 星野忠次, 今本公：計算化学的手法を用いた候補ペプチド設計． 日本薬学会第130年会, 29P-am413, 岡山（2010.3.29)
  9. 星野忠次，柳田浩志，松元輝礁，尾潟将一，浦野恵美子，村上 努，駒野 淳：抗HIV薬RNaseH活性阻害剤の開発． ナノ学会第８回大会, 講演予稿集S8I-1, 岡崎（2010.5.14)
  10. Suzuki, M., Hoshino, T., Neya, S. : Synthesis and Characterization of β-Alkyl Substituted Hexaphyrin(1.1.1.1.1.1). 5th International Symposium on Macrocyclic and Supramolecular Chemistry, P111（Poster）, Nara （2010.6.7)
  11. 根矢三郎、鈴木優章、星野忠次：非平面化ヘムがひき起こすヘムタンパク質の機能異常． 第３７回生体分子科学討論会、講演番号１１, 山口（2010.6.18-19)
  12. 鈴木優章, 星野忠次, 根矢三郎：Synthesis and characterization of beta-alkyl substituted hexaphyrin(1.1.1.1.1.1). 第20回金属の関与する生体関連反応シンポジウム、P-11, 徳島（2010.6.25)
  13. 根矢三郎、鈴木優章、星野忠次：New Molecular Design to Lower the Oxygen Affinity of Myoglobin.第２０回金属の関与する生体反応シンポジウム、O-13, 徳島（2010.6.25-26)
  14. Neya, S. : Molecular Insight of Heme Deformation to the Ligand Binding to Hemoproteins. Sixth International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines. S34-7 (Oral). New Mexico, USA. （2010.7.4-9)
  15. Ohgo, Y., Hashizume, D., Hayami, S., Mori, M., Nakamura, M., Neya, S., Takahashi, K. : Response of the dpi-ppi Interaction to the Environmental Stimuli in Iron(III) Heme. Sixth International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines. S34-8 (Oral). New Mexico, USA. （2010.7.4-9)
  16. 山岸純也, 沖本憲明, 末永敦, 岡田眞理子, 泰地真弘人, 星野忠次, 今本公：In silico prediction of peptide-crk binding affinity． CBRC Workshop 2010, 東京（2010.7.29)
  17. 根矢三郎、松ヶ枝隆、鈴木優章、星野忠次：新規ポルフィリン異性体“ピリコロール”の合成． 第２１回基礎有機化学討論会、Ａ０５, 名古屋（2010.9.9-11)
  18. 山岸純也, 沖本憲明, 末永敦, 岡田眞理子, 今本公, 泰地真弘人, 星野忠次：Strategy for Structure-Based Peptide Design． CBI 2010 annual meeting, 東京（2010.9.15)ポスター優秀賞受賞
  19. Liu X., Neya S., Hoshino T. :Dynamics motions of G-Protein-Coupled receptors embedded in lipid bilayer membranes with different kinds of molecular components. CBI 2010 annual meeting, Proceedings of CBI 2010, P1-04,CBI 2010 annual meeting, Tokyo（2010.9.15)
  20. Miyazaki, T., Neya, S., Teraoka, J. : A breathing Raman band reveals heme-globin interaction. 日本生物物理学会第48回年会、2SC0903,仙台（2010.9.20-22)
  21. 山岸純也, 沖本憲明, 末永敦, 岡田眞理子, 今本公, 星野忠次, 泰地真弘人：Computer-Aided Peptide Design. 日本生物物理学会第48回年会、仙台（2010.9.21)
  22. 沖本憲明，山岸淳也，末永敦, 岡田眞里子、今本公、星野忠次, 泰地真弘人：Computer-Aided Peptide Design: Application to Biomolecules. 第48回日本生物物理学会年会、仙台(2010.9)
  23. Neya, S., Suzuki, M., Hoshino, T. : Functional Ａnomaly of Hemoprotein Induced by Nonplanar Deformation of Heme. 60th Anniversary Conference in Japanese Coordination Chemistry. 2IB-18 (Invited Oral). Osaka. （2010.9.27-30)
  24. Ohgo,Y., Hashizume, D., Akahashi, K., Moris, H., Hayami, S., Neya, S., Nakamura, M. : Exploration and utilization of heme electronic structure. 60th Anniversary Conference in Japanese Coordination Chemistry. 2IB-19 Osaka. （2010.9.27-30)
  25. 星野忠次, 柳田浩志, 松元輝礁, 尾潟将一, 高江州善寿, 浦野恵美子, 市川玲子, 村上 努, 駒野 淳：新規HIV-1逆転写酵素RNase H活性阻害剤の開発．日本ウイルス学会学術集会, O3-2-07, 徳島（2010.11.9)
  26. 柳田浩志, 松元輝礁, 尾潟将一, 高江州善寿, 浦野恵美子, 市川玲子, 村上 努, 駒野 淳, 星野忠次：新規HIV-1逆転写酵素RNase H活性阻害剤開発における構造活性相関．日本エイズ学会学術集会, 2P-57, 東京（2010.11.25)
  27. 沖本憲明，山岸淳也，末永敦, 星野忠次, 泰地真弘人：計算機支援による合理的ペプチド設計手法の開発、第24回分子シミュレーション討論会．福井(2010.11.25)
  28. Hoshino T., Yanagita H., Komano J. (Invited) : Development of the inhibitory compounds for RNase H enzymatic activity of HIV-1 reverse transcriptase.4th International Symposium on Nanomedicine (ISNM2010), O-29-05 Okazaki （2010.11.29)
  29. 山本典生、柳田浩志、原崎一浩、佐藤人美、山本陽子、高久洋、高橋仁、原田勇一、中村一哉、浜本いつき、田代眞人、星野忠次：新規インフルエンザウイルス感染阻害化合物の計算機探索.第33回分子生物学会年会、1P-1036, 神戸(2010.12.7)
  30. 沖本憲明，山岸淳也，末永敦, 岡田眞里子、今本公、星野忠次, 泰地真弘人：Computer-Aided Peptide Design: Application to Biomolecules．第3回 バイオスーパーコンピューティングシンポジウム、神戸(2011.2)
  31. 山岸淳也，沖本憲明，末永敦, 岡田眞里子、今本公, 泰地真弘人、星野忠次：Computer-Aided Peptide Design: Strategy for Structure-Based Peptide Design． 第3回 バイオスーパーコンピューティングシンポジウム、神戸(2011.2)
  32. 沖本憲明，山岸淳也，末永敦, 星野忠次, 泰地真弘人：計算機支援による合理的ペプチド設計手法の開発．日本薬学第131年会、静岡(2011.3)
  33. 西村 龍, 柴田友和, 長尾 聡, 深谷昌史, 太 虎林, 長友重紀, 松尾貴史, 廣田俊, 鈴木秋弘,今井清博, 石上 泉, 小倉尚志, 根矢三郎, 山本泰彦：ヘム鉄の電子密度の変化を通したミオグロビンの機能調節機構の解明．日本化学会第91春季年会、講演番号4B6-05, 横浜(2011.3.29)
  34. 阿部　梢、加納博文、大友友則、根矢三郎、金子克己：ナノ細孔分子場による常圧下高圧有機合成の試み．日本化学会第91春季年会、講演番号1F2-31, 横浜(2011.3.29)
  35. 鈴木優章, 星野忠次, 根矢三郎：βアルキル置換ヘキサフィリン（1.1.1.1.1.1）の合成．日本薬学第131年会, 29P-0047, 静岡(2011.3.29)
  36. 根矢三郎, 鈴木優章, 星野忠次：人工酸素運搬物質開発のための非平面性ポルフィリンの合成と性質．日本薬学第131年会, 29P-0064、静岡(2011.3.29)
  37. 柳田浩志, 松元輝礁, 尾潟将一, 高江州善寿, 浦野恵美子, 市川玲子, 村上努, 駒野淳, 星野忠次：新規HIV-1逆転写酵素RNase H活性阻害剤開発における構造活性相関．日本薬学第131年会, 29P-0113、静岡(2011.3.29)
  38. 柳田浩志, 松元輝礁, 山本典生, 原崎一浩, 佐藤人美, 山本陽子, 高久洋, 高橋仁, 原田勇一, 中村一哉, 浜本いつき, 田代眞人, 星野忠次：新規インフルエンザウイルス感染阻害化合物の探索と合成．日本薬学第131年会, 31Y-am05、静岡(2011.3.31)
  39. 柳田 浩志, 松元 輝礁, 尾潟 将一, 高江州 善寿, 浦野 恵美子, 市川 玲子, 村上 努, 駒野 淳, 星野 忠次：新規HIV-1逆転写酵素RNase H活性阻害剤開発における構造活性相関．第21回金属の関与する生体関連反応シンポジウム、P-15、千葉(2011.5.30) ポスター賞受賞
  40. 不動聡志、高江洲善寿、石井和彦、小川博史、松浦崇晃、額賀路嘉、根矢三郎、星野忠次：HIV逆転写酵素RNase Hドメインの金属配位を伴う活性中心の構造解析.．第21回金属の関与する生体関連反応シンポジウム、P-23、千葉(2011.5.30)
  41. ムハマド イクバル, 松尾 佑里, 根矢 三郎, 星野 忠次：ヒト白血球抗原によるエピトープの認識に関する計算化学的解析．第21回金属の関与する生体関連反応シンポジウム、P-26、千葉(2011.5.30)

単行書

  1. 櫻井　弘、根矢　三郎、寺嶋孝仁：元素検定．化学同人、京都(2011)
  2. 根矢　三郎：「物理系薬学　Ｉ．物質の物理的性質、第2版」　日本薬学会編、スタンダード薬学シリーズ　２ 東京化学同人、東京2011年、40−51ページ

研究報告書 (平成22, 23年度)

特許

  1. 星野忠次、柳田浩志、山本典生, 発明の名称 ：「インフルエンザウイルス感染症の予防および／または治療剤」, （届出時：インフルエンザ治療薬の候補化合物）, 出願番号 ：特願2010-271861号, 出願日 ：平成22年12月6日

その他

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