研究業績 (2016, 2017)

[原著] [総説等] [学会発表] (written in Japanese and English)

原著

  1. Neya, S., Nagai, M., Nagatomo, S., Hoshino, T., Yoneda, T., Kawaguchi, A. T. : Utility of heme analogues to intentionally modify heme-globin interactions in myoglobin. Biochim Biophys Acta. 1857(5), 582-588 (2016); DOI: 10.1016/j.bbabio.2015.09.009
  2. Fudo, S., Yamamoto, N., Nukaga, M., Odagiri, T., Tashiro, M., Hoshino T. : Two distinctive binding modes of endonuclease inhibitors to the N-terminal region of influenza virus polymerase acidic subunit. Biochemistry 55 (18), 2646-2660 (2016) DOI: 10.1021/acs.biochem.5b01087
  3. Fukuda, M., Takatori, A., Nakamura, Y., Suganami, A., Hoshino, T., Tamura, Y., Nakagawara A. : Effects of novel small compounds targeting TrkB on neuronal cell survival and depression-like behavior. Neurochemistry International 97, 42-48 (2016) DOI: 10.1016/j.neuint.2016.04.017
  4. Kanai Y., Nishimura R., Nishiyama K., Shibata T., Yanagisawa S., Ogura T., Matsuo T., Hirota S., Neya S., Suzuki A., Yamamoto Y. : Effects of Heme Electronic Structure and Distal Polar Interaction on Functional and Vibrational Properties of Myoglobin. Inorg. Chem. 55, 1613-1622 (2016)
  5. Yoneda T.,　 im T., Soya T., Neya S., Oh J., Kim D., Osuka A. : Conformational Fixation of a Rectangular Antiaromatic [28]Hexaphyrin Using Rationally Installed Peripheral Straps. Chem. Eur. J. 22, 4413-4417 (2016)
  6. Neya, S., Yoneda, T., Hoshino, T., Kawaguchi, A. T., Suzuki, M. : Synthesis of Type III Isomers of Diacetyldeutero-, Hemato-, and Protoporphyrins with the Use of Knorr's Pyrrole. Tetrahedron 72, 4022-4026 (2016)
  7. Hoshino, T., Matsuo, K., Komano, J., Maeda, F., Takekoshi, M. : Enhancement of the stability of single chain Fv molecules with the amino acid substitutions predicted by high-performance computer. Asia Pacific Biotech News 20, 32-34 (2016)
  8. Suzuki M., Neya S., Nishigaichi Y. : Synthesis of 5,10-Bistrifluoromethyl Substituted beta-Octamethylporphyrin and Central-metal Dependent Solvolysis of Their meso-Trifluoromethyl Group. Molecules 21, 252 (2016)
  9. Suzuki M., Neya S., Nishigaichi Y. : Irregular C-C Bond Creations between Recombined N-Fused Pentaphyrin and Aminic Nucleophiles. J. Porphyrins Phthalocyanines 20, 738-743 (2016)
  10. Shibata T., Kanai Y., Nishimura R., Xu L., Moritaka Y., Suzuki A., Neya S., Nakamura M., Yamamoto Y. : Characterization of Ground State Electron Configurations of High-Spin Quintet Ferrous Heme Iron in Deoxy Myoglobin Reconstituted with Trifluoromethyl Group-Substituted Heme Cofactors. Inorg. Chem. 55, 12128-12136 (2016)
  11. Yoneda T., Soya T., Neya S., Osuka A. : [62]Tetradecaphyrin and Its Mono- and Bis-Zn(II) Complexes. Chem. Eur. J. 22, 14518-14522 (2016)
  12. Osajima T., Hoshino T. : Roles of the respective loops at complementarity determining region on the antigen-antibody recognition. Comput. Biol. Chem. 64, 368-383 (2016)
  13. Urano E., Miyauchi K., Kojima Y., Hamatake M., Ablan S. D., Fudo S., Freed E. O., Hoshino T., Komano J. : A triazinone derivative inhibits HIV-1 replication by interfering with reverse transcriptase activity. Chem. Med. Chem. 11, 2320-2326 (2016)
  14. Kobayashi S., Hoshino T., Hiwasa T., Satoh M., Rahmutulla B., Tsuchida S., Komukai Y., Tanaka T., Matsubara M., Shimada H., Nomura F., Matsushita K. : Anti-FIRs (PUF60) auto-antibodies are detected in the sera of early-stage colon cancer patients. Oncotarget 7, 82493-82503 (2016)
  15. Fudo S., Qi F., Nukaga M., Hoshino T. : Influence of precipitants on molecular arrangement and space group of protein crystals. Cryst. Growth Des. 17, 534-542 (2017)
  16. Fuji H., Qi F., Qu L., Takaesu Y., Hoshino T. : Prediction of ligand binding affinity to target proteins by molecular mechanics theoretical calculation. Chem. Pharm. Bull. 65, 461-468 (2017)
  17. Neya, S., Yoneda, T., Omori, T., Hoshino, T., Kawaguchi, T. A., and Suzuki, M. : Synthesis of 1,4,5,8-tetraethyl-2,3,6,7-tetravinylporphyrin from a Knorr’s pyrrole analogue. Tetrahedron 73, 6780-6785 (2017)
  18. Kanai, Y., Harada, A., Shibata, T., Nishumura, R., Namiki, K., Watanabe, M., Nakamura S., Yumoto F., Senda T., Suzuki A., Neya S., and Yamamoto Y. : Characterization of Heme Orientational Disorder in a Mioglobin Reconstituted with a Trifluoromethyl Group-Substituted Heme Cofactor. Biochemistry 56, 4500-4508 (2017)
  19. Cha, W.-Y., W. Kim, W., Mori, H., Yoneda, T., Osuka, A., and Kim, D., Soya, T. : S2 Fluorescence from [26]Hexaphyrin Dianion. J. Phys. Chem. Lett. 8, 3795-3799 (2017)
  20. Yoneda T., Hoshino T., Neya S. : Stable Non-fused [22]Pentaphyrins and A Fused [24]Pentaphyrin Displaying Crystal Polymorphism between Huckel and Mobius Structures. Chem. Asian. J. 12, 405-409 (2017)

    21. 総説等

    学会発表

    1. Neya, S., Kawaguchi, A. T.：Design of heme-protein interactions in myoglobin to develop myoglobin-based artificial oxygen carriers (MBOCs).第8回武田科学振興財団薬科学シンポジウム、吹田市（2016.1.21-22)
    2. 木下 真志、片平　祐弥、柴田 友和、山本 泰彦、逸見　光、根矢　三郎、鈴木 秋弘：ヘムと四重鎖DNAの複合体におけるヘム鉄の配位構造の解析.日本化学会第96春季年会、京田辺市（2016.3.24-27)
    3. 米田 友貴、星野 忠次、根矢 三郎：メゾアリール‐ベータアルキルハイブリッド型ぺンタフィリンの合成と物性.日本化学会第96春季年会、京田辺市（2016.3.25)
    4. 不動 聡志、斉 非、額賀 路嘉、米田 友貴、根矢 三郎、星野 忠次：タンパク質の結晶化における沈殿剤の影響の解析.PFシンポジウム（物構研サイエンスフェスタ）、つくば市（2016.3.15)
    5. 不動 聡志、斉 非、額賀 路嘉、米田 友貴、根矢 三郎、星野 忠次：タンパク質の結晶化における沈殿剤の影響の解析.日本薬学会第136年会, 27L-pm03, 横浜（2016.3.27)
    6. 米田 友貴、星野 忠次、根矢 三郎：メゾアリール‐ベータアルキルハイブリッド型環拡張ポルフィリンの合成とその物性.日本薬学会第136年会, 28AB-am123, 横浜（2016.3.28)
    7. 根矢 三郎、米田 友貴、星野 忠次、鈴木 優章：ヘムタンパク質構造解析のための対称的プロトポルフィリン合成.日本薬学会第136年会, 28AB-pm406, 横浜（2016.3.28)
    8. 鈴木 港貴、米田 友貴、根矢 三郎、星野 忠次：新規 HIV-1 逆転写酵素 RNase H 活性阻害剤開発における構造活性相関.日本薬学会第136年会, 28AB-am248, 横浜（2016.3.28)
    9. 斉 非、不動 聡志、根矢 三郎、星野 忠次：分子動力学計算によるタンパク質構造の結晶形の影響除去.日本薬学会第136年会, 28AB-pm423, 横浜（2016.3.28)
    10. 近藤 翔太、林 初咲、不動 聡志、額賀 路嘉、米田 友貴、根矢 三郎、星野 忠次：新規メタロ-β-ラクタマーゼ阻害剤における構造活性相関研究.日本薬学会第136年会, 28AB-pm424, 横浜（2016.3.28)
    11. ヴァヘド マジド、星野 忠次、米田 友貴、根矢三郎、松崎 勝巳：計算機シミュレーションにするアミロイドベータの生体脂質膜への吸着過程の解析.日本学会第136年会, 28AB-pm425, 横浜（2016.3.28)
    12. Yoneda, T., Kim, T., Soya, T., Neya, S., Oh, J., Kin, D., Osuka, A.：Conformational Fixation of A Rectangular Antiaromatic [28]Hexaphyrin Using Rationally Installed Peripheral Straps.2nd International Symposium on pi-System Figuration, Saitama（2016.4.14)
    13. 根矢 三郎、米田 友貴、星野 忠次、鈴木 優章：ヘムタンパク質物理化学解析のための対称型ポルフィリンの新規合成法.第26回金属の関与する生体関連反応シンポジウム, 北海道大学（2016.6.17-18)
    14. 並木 孝介、柴田 友和、根矢 三郎、鈴木 秋弘, 山本 泰彦：ヘムの化学修飾がメトアジドミオグロビンのスピン平衡に与える影響.第26回金属の関与する生体関連反応シンポジウム, 北海道大学（2016.6.17-18)
    15. 渡邉 美帆、金井 佑生、西村 龍、柴田 友和、松尾 貴史、廣田 俊、鈴木 秋弘、根矢 三郎、山本 泰彦：ミオグロビンの機能調節におけるヘムの電子構造の変化と遠位アミノ酸変異による影響.第43回生体分子科学討論会, 名古屋大学（2016.6.25)
    16. Neya, S., Yoneda, T., Hoshino, T., Suzuki, M.：Practical Synthesis of Symmetric Isomers of Diacetyl-, Hemato-, and Protoporphyrins.9th International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines, Nanjing, China（2016.7.3-8)
    17. Yoneda, T., Kim, T., Soya, T., Neya, S., Oh, J., Kin, D., Osuka, A.：Conformational Fixation of A Rectangular Antiaromatic [28]Hexaphyrin Using Rationally Installed Peripheral Straps.9th International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines, Nanjing, China（2016.7.3-8)
    18. 米田友貴、星野忠次、根矢三郎：メゾアリール ベータアルキルハイブリッド型ペンタフィリンの合成とその物性.第27回基礎有機化学討論会, 広島（2016.9.3)
    19. 山本 泰彦、片平 祐弥、中山 優作、柴田 友和、渡部 明莉、中尾 知美、柳澤 幸子、小倉 尚志、鈴木 秋弘、根矢 三郎：ヘムと四重鎖DNAの複合体の触媒機能測定と構造解析.第10回バイオ関連化学シンポジウム, 金沢（2016.9.7-9)
    20. 根矢 三郎、米田 友貴、星野 忠次、鈴木 優章：ヘムタンパク質の構造解析のための対称的天然型ポルフィリンの新規合成法.錯体化学会第66回討論会, 福岡（2016.9.10-12)
    21. Yoneda, T.(Invited)：Metal Complexes of Expanded Porphyrins with Giant Huckel Aromatic and Antiaromatic, and Mobius Aromatic Macrocycles.Elsevier Reaxys PhD Prize 2016, Finalists Lectures, London, UK（2016.9.22)
    22. Yamamoto Y., Shibata T., Katahira Y., Nakayama Y., Tai H., Matsui T., Morihashi K., Watanabe A., Nakao T. , Yanagisawa S., Ogura T., Suzuki A., Neya S.：Characterization of Complexes between Hemes and Parallel G-Quadruplex DNAs.8th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference. Auckland, New Zealand（2016.12.4-9)
    23. ヴァヘド マジド、星野 忠次、米田 友貴、根矢三郎、松崎 勝巳：GM1 Ganglioside-Containing Lipid Membrane and Aggregation of Amyloid Beta Peptides:Alzheimer’s Related Protein.計算科学研究センタースーパーコンピューターワークショップ2017, 岡崎（2017.2.1)
    24. Yoneda, T., Mori, D., Hoshino, T., Neya, S.：Aromaticity, Reactivity, and Coordination Property of meso-Aryl β-Alkyl Hybrid Pentaphyrins.日本化学会年会第97年会, 横浜（2017.3.17)
    25. Yoneda, T.（招待講演）：Aromaticity of Giant Expanded Porphyrins.日本化学会年会第97年会, Reaxys PhD Prize in Japan, 横浜（2017.3.17)
    26. 渡邉 美帆、金井 佑生、西村 龍、柴田 友和、松尾 貴史、廣田 俊、柳澤幸子、小倉 尚志、鈴木 秋弘、根矢 三郎、山本 泰：ヘムの系統的化学修飾および遠位アミノ酸置換がミオグロビンの機能に与える影響.日本化学会年会第97年会, 横浜（2017.3.16-19)
    27. 並木 孝介、柴田 友和、鈴木 秋弘、根矢 三郎、山本 泰彦：還元型西洋わさびペルオキシダーゼのヘムにおける五重項電子状態の解析.日本化学会年会第97年会, 横浜（2017.3.16-19)
    28. 山田祐也、細田悠、井手雄紀、森重樹、根矢三郎、中村幹夫、池上崇久：ピリジンN-オキシドを有するテトラアルキルポルフィリン鉄(III)錯体の構造と動的挙動.日本化学会年会第97年会, 横浜（2017.3.16-19)
    29. 鈴木 優章, 根矢 三郎, 西垣内 寛：分岐π平面を有するN―フューズドペンタフィリン誘導体の合成.日本学会第137年会, 25PA-pm109, 仙台（2017.3.25)
    30. 斉 非, 米田 友貴, 根矢 三郎, 星野 忠次：タンパク質構造の結晶依存性が消失するのに必要な分子動力学シミュレーションの計算時間.日本薬学会第137年会, 25PB-am035, 仙台（2017.3.25)
    31. 瞿 良, 米田 友貴, 根矢 三郎, 星野 忠次：タンパク質複合体構造の計算予測.日本薬学会第137年会, 25PB-am040, 仙台（2017.3.25)
    32. 北原 真理子, 小向 勇士, 額賀 路嘉, 米田 友貴, 根矢 三郎, 星野 忠次：インフルエンザウイルスエンドヌクレアーゼ活性阻害化合物の合成と結合構造解析.日本薬学会第137年会, 25PB-am043, 仙台（2017.3.25)
    33. 根矢 三郎, 星野 忠次, 米田 友貴：βモノアザポルフィリンのpHに依存した光吸収変化解析.日本薬学会第137年会, 25PB-pm045, 仙台（2017.3.25)
    34. 米田 友貴, 森 大樹, 星野 忠次, 根矢 三郎：メゾアリールーベータアルキルハイブリッド型ペンタフィリンの物性解析.日本薬学会第137年会, 26P-pm12, 仙台（2017.3.26)
    35. 鈴木 港貴, 小向 勇士, 米田 友貴, 根矢 三郎, 星野 忠次：新規HIV-1逆転写酵素RNaseH活性阻害剤の合成及び構造活性相関.日本薬学会第137年会, 26PA-am073, 仙台（2017.3.27)
    36. Namiki K., Shibata T., Neya S., Suzuki A., Yamamoto Y.：Characterization of Peroxidase Cycle through a Change in Electron Density of Heme Fe Atom.6th Georgian Bay International Conference on Bioinorganic Chemistry. Tronto, Canada（2017.5.23-27)
    37. Yamamoto Y., Shibata T., Katahira Y., Ochi K., Nakayama Y., Tai H., Watanabe A., Nakao T., Yanagisawa S., Ogura T., Hemmi H., Hagihara M., Suzuki A., Neya S.：Hemes-DNA Complexs.14th International Symposium on Applied Bioinorganic Chemistry. Toulouse, France（2017.6.7-10)
    38. Neya S., Omori H., Hoshino T., Yoneda T.：Synthesis and Structure of Tetraethyltetravinylporphyrin──a Novel Molecular Tool to Regulate the Pi Electronic Structure.第27回金属の関与する生体関連反応シンポジウム．東京（2017.6.16-17)
    39. Ohta T., Shibata T., Kobayashi Y., Suzuki A., Neya S., Yoda Y., Seto M., Yamamoto Y., Ogura T.：Nuclear resonance vibrational spectroscopic study of diatomic gas sensing mechanism of myoglobin.第17回日本蛋白質科学会年、仙台（2017.6.20-22)
    40. Yoneda T., Hoshino T., Neya S.:Synthesis of meso-Aryl β-Alkyl Hybrid Pentaphyrins.17th International Symposium on Novel Aromatic Compounds (ISNA-17). New York, United States（2017.7.24)
    41. Neya S.Utility of heme analogues to design heme-globin interactions in myoglobin.18th International Conference on Biological Inorganic Chemistry. Florianopolis, Brazyl（2017.7.31-8.4)
    42. 根矢三郎（招待講演）：ミオグロビンの機能解析に向けたヘム−グロビン相互作用の分子設計.生体機能化学部会若手の会第29回サマースクール，松江（2017)
    43. 星野忠次（招待講演）：金属原子を活性中心に持つウイルス酵素とその阻害剤開発.第30回生物無機化学夏季セミナー，白子（2017.8.31)
    44. 森 大樹, 米田 友貴, 星野 忠次, 根矢 三郎：β‐アルキル‐メゾ‐アリール置換型のサフィリン及び含ピリジン環拡張ポルフィリンの合成とその物性.第28回基礎有機化学討論会，福岡（2017.9.7)
    45. 森 大樹, 米田 友貴, 星野 忠次, 根矢 三郎：ベータ置換ビピロールエタンを用いたペンタフィリン(2.1.1.1.1)およびジヒドロホモポルフィリン(2.1.1.1)の合成とその物性.第28回基礎有機化学討論会，福岡（2017.9.7)
    46. 根矢三郎, 米田友貴, 大盛隼人, 星野忠次, 鈴木優章：1,4,5,8-テトラエチル-2,3,6,7-テトラビニルポルフィリンの合成、構造および有用性.第28回基礎有機化学討論会，福岡（2017.9.7)
    47. 根矢 三郎, 米田 友貴, 星野 忠次, 大盛 隼人：Synthesis and Properties of 1,4,5,8-tetraethyl-2,3,6,7-tetravinylporphyrins.錯体化学第67回討論会, 札幌（2017.9.17)

    単行書

    1. 根矢　三郎：「クライトン 生物無機化学」（塩谷光彦監訳）(22章担当) 東京化学同人、東京2016年3月

    研究報告書 (平成27, 28年度)

    特許

    その他

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